2010年秋天，世界卫生组织工作人员小林英子和他的团队前往菲律宾开展遏制禽流感疫情的工作。疫情很快得到控制，但仍有感染者从疫区潜逃。次年，在东京一家市立医院，一位刚被松冈医生收治的高烧患者入院后急转直下，咳血不治身亡。患者家属和部分医生也因感染而崩溃。与此同时，附近一家养鸡场检测出禽流感病毒，主人沈仓和女儿平静的生活被打破。小林英子被派去指导防疫工作，她的老朋友松冈担任她的助手。疫情迅速蔓延，一个月内死亡人数达到2000人。各地爆发恐慌，引起国际关注。政府迅速封锁了受灾地区。松冈偶然发现病毒的起源可能在其他地方。从海外发来的检测结果证实了他的猜测，于是他决定去海外寻找病原体。在这个前所未有的疫情，松冈、小林和坎佐将各自面临他们选择的考验。