东京湾附近接连发生破坏事件。九祖密和城南派出所刑警秦某负责侦办此案。在调查过程中，秦结识了大学讲师沙耶子，并逐渐对她产生了好感。随后，琴和库虎生活在东京湾的后备基地遭遇不断吞噬人类的外星怪物。原本以为这个怪物才是连环袭击的真正元凶，但怪物留在现场的一块块肉带来了扭转局势的重大转机。事件的真相牵涉到警视厅、防卫部、特种车辆二部，同时也揭露了琴从来不知道的沙耶子的另一面。光明之下隐藏着令人震惊的真相，黑暗中自卫队已经开始行动。就在秦绝望的时候，怪物再次出现在东京湾。为了结束这场苦战，机动警力挺身而出。